Gnucobol no soporta archivos indexados, necesita un FILE HANDLER o manejador de archivos indexados como VBISAM
ISAM File handler download | SourceForge.net o migrar a motor sql (sqlite ejemplo)
los indexados tipo rmcobol ni usando VBISAM son soportados
una alternativa es usar DISAM filehandler
DISAM FileHandler | Fast ISAM for New and Legacy data development, pero hay que compilar gnucobol para "saber" si funciona, yo no lo he probado
lo ideal seria convertir Micro focus: index file ----> secuential file -----> gnucobol index file